Goyô nous plonge dans le quotidien de Masa, samouraï congédié par son maitre, qui se fait engager par Yaichi comme garde du corps. Jeune homme étrange et mystérieux, il est en fait le chef d’une bande de brigands, les Goyô.

Le ronin Masa participe alors, sans véritablement savoir quoi en penser, à un enlèvement contre rançon, spécialité des Goyô.

Fasciné par cette bande d’excentriques singuliers, Masa se voit de plus en plus impliqué dans leurs actions mais est aussi de plus en plus perdu, sa conscience ne sachant trop l’aiguiller.